一、发生流产、早产、死产及新生儿窒息
孕妇如患有乙型肝炎对胎儿影响较大，特别是妊娠后常可导致流产、死胎等。流行病学调查表明，妊娠后3个月患乙型肝炎孕妇的早产率、死胎率、新生儿窒息率分别为43.1％、26.7％、14.8％，明显高于非乙型肝炎孕妇的10％、0％ 、2.8％。孕妇患慢性肝炎或肝硬化时，如果病情静止，代偿功能较好，对胎儿的影响较小。
二、引起胎儿畸形
流行病学调查发现，妊娠早期患乙型肝炎者胎儿有发生腭裂的病例，乙肝病毒可以致畸。后来又有科研人员认为乙型肝炎病毒与先天愚型有因果关系。国内有报告，婴儿出生时母亲患乙型肝炎，出生后第二天婴儿死亡，尸体解剖证实患有乙型肝炎，认为是先天性肝炎，说明乙肝病毒致畸的可能性是肯定的。
三、形成婴儿肝炎病毒携带状态
孕妇患乙型肝炎，其婴儿感染率为46.5% ～100％。如在妊娠后2个月内患乙肝，婴儿感染率可高达70％。在所有乙肝病毒急性感染者中约有10％转变成慢性，婴幼儿时期感染乙肝病毒易发展成为慢性携带状态，发生感染的年龄愈小，乙肝表面抗原阳性率愈高，形成持续性感染的机会愈大。1岁内的婴儿感染乙肝病毒后，约有70% ～90％发展为乙肝表面抗原慢性携带者；1～5 岁感染乙肝病毒的儿童有30% ～50％发展成为慢性携带者。
由于新生儿免疫功能尚不健全，被感染后绝大多数（95％以上）成为乙肝病毒携带者，多数不能自然转阴。其中一部分可发展为各型肝炎，甚至发展为肝硬化、肝癌，这也是我国人群中乙肝病毒携带者的主要来源。