通过良好温和的水对全身皮肤外周血管的拍击、安抚作用，让裸露的新生儿在水中自主的全身运动,增加肌肉活动强度,调节血液循环的速度,增强心肌收缩力,增加肺活量,提高新生儿抵抗疾病的免疫力.
对消化和运动系统的影响
新生儿经过游泳锻炼,胃肠道激素如促胃激素、胰岛素释放增多，激素分泌增加，迷走神经兴奋，使食欲增强，有效母乳喂养次数增多，并加强了对食物的消化吸收，增加体重，增强体质，同时促进体内鸟氯酸脱羟酶与生长激素水平的升高，使新生儿生长速度加快。
刺激神经系统发育
皮肤是人体最大的感觉器官也是神经系统的外在感受器，大约有500万个感觉细胞能接受外界的很多刺激，水疗的良性刺激可以促进神经系统的发育。新生儿出生时，脑神经细胞大部分已分裂成形，外界的刺激越频繁、越强烈，脑神经细胞的发育越迅速。
有利于增强骨骼系统的灵活性和柔韧性
新生儿游泳时，身体在晃动的水中要保持平衡，四肢在不停地运动，促进了运动系统（骨骼、关节、肌肉）的发育。
对其他方面的影响
游泳时皮肤与加入水疗溶质的泳液广泛接触，能改善皮肤新陈代谢，显著减少新生儿湿疹和新生儿红斑的发生。新生儿游泳还能增强应激反应，促进小儿正常睡眠节律的建立，减少哭闹。在新生儿游泳过程中，邀请产妇及家属积极参与，新生儿在水中安静、满足的表情是心与心的交流，有利于新生儿的生长发育和人格的完善，有利于宝宝的健康成长。